Der bekannte Kapitän Thomas Roth hatte zu diesem Zeitpunkt die Kontrolle über die Mein Schiff 2. Die erste Reise der Mein Schiff 2 nach dem Neustart war zeitgleich auch die erste Kreuzfahrt unter komplett neuen Gegebenheiten. Unter anderem wurde erstmals das erweiterte Hygiene- und Sicherheitsprotokoll angewendet, das die bereits vor der Pandemie sowieso schon hohen Hygienemaßnahmen noch einmal deutlich erweitert hat. So wurde unter anderem die Anzahl der Desinfektions- und Reinigungsvorgänge der öffentlichen Bereiche deutlich erhöht. Einer der emotionalsten Momente dieser Kreuzfahrt war es, als die Mein Schiff 4 und die Mein Schiff 6 die Mein Schiff 2 ein kleines Stück in der Deutschen Bucht begleiteten. 

Bereits nach einem kurzem Zeitraum konnte ein weiteres Schiff der TUI Cruises-Flotte den Betrieb wieder aufnehmen. Es handelte sich um die Mein Schiff 1, die ab dem 03.08.2020 ab / bis Kiel eingesetzt wurde. Auch sie bot sowohl Kurzreisen, als auch einwöchige Kreuzfahrten – Panoramafahrten – an – ebenfalls ohne Landgang. 

Besagte Landgänge konnten mit der Dienstaufnahme der Mein Schiff 6 durchgeführt werden, jedoch nur in der Form von über die Reederei gebuchte Ausflüge. Die Mein Schiff 6 startete in Griechenland und konnte bis zum erneuten griechischen Lockdown zahlreiche Kreuzfahrten absolvieren.

Die Mein Schiff 2 führte ihre Reisen bis November 2020 ab / bis Deutschland aus und wechselte dann auf die Kanaren. Die Mein Schiff 1 ist seit 17.12.2020 ebenfalls auf den Kanarischen Inseln unterwegs. Dies sind die einzigen beiden Schiffe der Hamburger Reederei die zum jetzigen Stand mit Gästen an Bord unterwegs sind.